Das Kirchenmusikreferat vernetzt die kirchenmusikalische Arbeit in den Kirchengemeinden und organisiert Konzerte, die Marktmusik in St. Nikolaus oder den Orgelherbst im Rahmen des Bodenseefestivals. Die zahlreichen Chöre mit mehreren hundert aktiven Sängerinnen und Sängern in den Kirchengemeinden bereichern das musikalische Angebot in der Stadt – sei es konzertant oder einfach durch die pure Freude am Gesang. Drei hauptamtliche Kirchenmusiker und zahlreiche nebenamtliche Musiker bringen ihre musikalischen Fähigkeiten ein. Auch der Unterhalt wertvoller Orgeln trägt dazu bei, dass die Katholische Kirche sich als ein Träger der Kultur in Friedrichshafen sieht.